Основными задачами Центра электромагнитной совместимости являются: выполнение функций радиочастотного органа; присвоение и учет рабочих радиочастот и позывных сигналов РЭС и ВЧУ гражданского назначения на территории Республики Узбекистан; радиомониторинг радиочастотного спектра на территории Республики Узбекистан; обеспечение электромагнитной совместимости при распределении и присвоении радиочастот и т.д.